پایان نامه ارشد:استفاده ازماده ترت بوتیل هیدروپراکساید t-BHPیک مدل حیوانی از استرس اکسیداتیو به منظور مطالعه اثر آن در چگونگی بیان ژن (Kdm5d(Smcy | ... | |
مقدمه. 2 فصل اول کلیات
1-1- علل ناباروری در مردان.. 4 1-2- رادیکالهای آزاد. 5 1-2-1- تعریف و نحوه تشکیل رادیکالهای آزاد. 5 1-2-2- نحوه عملکرد رادیکالهای آزاد. 5 1-2-3- گونههای فعال اکسیژن و نیتروژن.. 5 1-2-3-1- نقشهای بیولوژیک ROS.. 6 1-2-4- تولید و منبع رادیکالهای آزاد. 6 1-2-4-1- تولید ROS توسط اسپرماتوزوآی غیر طبیعی.. 7 1-2-4-2- تولید ROS توسط لکوسیتها 7 1-2-5- استرس اکسیداتیو. 8 1-2-5-1- مکانیسم عملکرد استرس اکسیداتیو. 8 1-2-5- اثرات استرس اکسیداتیو. 9 1-2-5-1- استرس اکسیداتیو و آسیب به DNA… 9 1-2-6-1-2- اهمیت سلامت DNA اسپرم. 11 1-2-6-2-استرس اکسیداتیو در اسپرم. 12 1-2-6-3- استرس اکسیداتیو و بیماریهای دیگر. 12 1-2-7- اثراتROS.. 13 1-2-7-1- پراکسیداسیون لیپیدی غشای پلاسمایی اسپرم. 13 1-2-7-2- اثر روی تحرک اسپرم. 13 1-2-8- ROS و استرس اکسیداتیو مایع منی.. 13 1-2-9- ROS و ناباروری.. 14 1-2-10- آنتی اکسیدانها 15 1-2-10-1- نحوه عملکرد آنتیاکسیدانها به دو روش طبقه بندی میشود: 16 1-2-11- اثرات آنتیاکسیدانها 18 1-2-11-1- تاثیر بر تحرک اسپرم. 18 1-2-11-2- تاثیر بر روی کاهش آسیبهای بعد از انجماد اسپرم. 18 1-2-11-3- تاثیر آنتیاکسیدانها در جلوگیری از آسیب بهDNA… 18 1-2-12- نقش آنتیاکسیدانها (ربایندههایبالقوهROS) دراسپرم. 19 3-1- ژنتیک و ناباروری مردان.. 20 1-3-1- ژن انتخابی مورد مطالعه. 21 1-4- اهداف: 22 1-5-فرضیات: 22 فصل دوم مروری بر مطالعات گذشته24 فصل سوم مواد و روشها
3-2- جمع آوری نمونهها و محل انجام آزمایش…. 30 3-3- القاء استرس اکسیداتیو با تزریق t-BHP.. 31 3-4- تک سلول کردن بافت بیضه. 31 3-5- شمارش تعداد سلولهای زنده در بافت بیضه. 32 3-6-1- روش فلوسایتومتری.. 32 3-6-2- سنجش ROS در بیضه بوسیله فلوسایتومتری.. 34 3-7- روشهای تعیین آسیب DNA اسپرم. 35 3-7-1- تست TUNEL جهت ارزیابی شکست DNAاسپرم. 36 3-7-2- جمعآوری سلولهای اسپرمی جهت آنالیز شکستهای DNA اسپرم. 37 3-7-3- محلولها و بافرهای مورد نیاز جهت روش TUNEL، به منظور ارزیابی شکست DNA اسپرم. 39 3-7-4- مراحل انجام آزمایش TUNEL.. 39 3-7-5- نحوه استفاده از کیت TUNEL.. 40 3-8- بررسی بیان ژن Kdm5d یا Smcy. 40 3-8-1- استخراج RNA به روش ترایزول.. 41 3-8-2- بررسی کیفی RNAهای استخراج شده به وسیله الکتروفورز روی ژل آگارز 42 3-8-3- تیمار کردن نمونههای RNAی استخراج شده 43 3-8-4- سنتزDNA مکمل (cDNA) از روی الگوی RNA… 44 3-8-5- روش انجام واکنش زنجیرهای پلی مراز (PCR) جهت اطمینان از سنتز cDNA… 46 3-8-6-روش تهیهی ژل آگارز و انجام الکتروفورز 48 3-8-7- طرز تهیهی محلولها 48 1- بافر50x TAE.. 48 2- محلول رنگ آمیزی اتیدیوم برماید (10mg/ml) 48 3-8-8- بررسی کمی بیان ژن با استفاده از روش واکنش زنجیرهای پلیمرازپیوسته. 49 3-8-8-1-روش Ct مقایسهای برای کمی سازی نسبی.. 50 3-8-6- آنالیز آماری.. 52 فصل چهارم نتایج 4-1- بررسی وزن بدن و بافت بیضه پس از 14 روز تزریق.. 54 4-2- بررسی ماکروسکوپی بافت بیضه. 55 4-3- بررسی میزان ROS در بیضهی گروه کنترل و آزمون.. 56 4-3-1- اندازه گیری میزان O2 و H2O2 56 4-4- نتایج ارزیابی شکست DNA اسپرم با تست TUNEL.. 59 4-5- بررسی وضعیت بیانی ژن Kdm5d در بافت بیضه. 61 4-5-1- استخراج RNA کل از بافت بیضه. 61 4-5-2- بررسی صحت سنتز cDNA… 62 4-5-3- بررسی بیان کمی ژن Kdm5d در بافت بیضه. 63 فصل پنجم بحث و نتیجهگیری 5-1- بحث و نتیجه گیری کلی.. 67 5-2- پیشنهادات: 70 منابع.. 71 خلاصه انگلیسی… 80 ضمائم.. 81 فهرست جداول عنوان صفحه جدول 1-1: انواع آنتیاکسیدانها و مکانیسم عملکرد آنها 17 جدول 3-1: ترکیب محیط TCM…. 38 جدول 3-2: ترکیب محیط 38 جدول 3-3: ژن مورد نظر و توالی پرایمر مورد استفاده 40 جدول 3-4: مواد مورد استفاده در تیمار نمونههایRNA… 43 جدول 3-5: مواد مورد استفاده در سنتزcDNA… 45 جدول 3-6: برنامه دمایی سنتز cDNA… 45 جدول 3-7: مواد مورد استفاده در RT-PCR… 47 جدول 3-8: برنامه دمایی RT-PCR و تعداد سیکلهای هر مرحله. 47 جدول 3-9: اجزای لازم برای انجام واكنش Real-Time PCR… 51 جدول 3-10: برنامه دمایی Real-Time PCR… 51 جدول 4-1: میانگین وزن بدن در طول تزریق و بافت بیضه پس از 14 روز تزریق.. 54 جدول 4-2: میزان درصد H2O2 و O2 موجود در دو گروه کنترل و آزمون در نمونههای بیضهای با استفاده از تکنیک فلوسایتومتری.. 58 جدول 4-3: درصد شکست DNA اسپرم با روش TUNEL در گروه کنترل و آزمون.. 60 جدول 4-4: دادههای گزارش شده برای آنالیز کمی ژن Kdm5d.. 64 جدول 4-5: آنالیز نتایج Real-Time PCR با استفاده از نرم افزار REST.. 64 فهرست اشکال عنوان صفحه شکل 1-1: ارتباط بین ATMو P53 در پاسخهای ترمیم DNA یا آپوپتوز حاصل از آسیب ایجاد شده توسط استرس اکسیداتیو. 9 شکل 1-2: ارتباط بین افزایش تولید ROS با ناباروری.. 15 شکل 1-3: فشردگی کروماتین قبل از ورود به میوز توسط کمپلکس Smcy-MSH5.. 21 شکل 3-1: شمایی از لام نئوبار 32 شکل 3-2: DCFH-DA و مکانیسم عمل آن.. 34 شکل 3-3: روشهای ارزیابی شکست DNA و نحوه تشخیص آنها 36 شکل3-4: اساس روش TUNEL.. 37 شکل 4-1: نمونههای بافت بیضه در موشهای کنترل و آزمون.. 56 شکل 4-2: ارزیابی آسیب DNA در نمونه آزمون با روش TUNEL با استفاده از میکروسکوپ فلورسنت(1000×) 60 شکل 4-3: نمونه RNAهای استخراج شده از بافت بیضه. 62 شکل 4-4: محصولات RT-PCR. 63 شکل 4-5: منحنی تفکیک ژن مربوطه. 65 فهرست نمودار عنوان صفحه نمودار 4-1: مقایسه وزن بدن و بافت بیضه میان گروه کنترل و آزمون. 55 نمودار 4-2: نمودار هیستوگرام از سلولهای بیضهای در یکی از نمونههای گروه کنترل و آزمون.. 57 نمودار 4-3: نتیجه حاصل از بررسی میزان ROS (H2O2 و ̊O2) در نمونههای بیضه بین دو گروه کنترل و آزمون 59 نمودار 4-4: نتیجه حاصل از بررسی میزان شکست DNA در نمونههای اسپرم بین دو گروه کنترل و آزمون 61 نمودار 4-5: نمودار بیان نسبی ژنKdm5d. 65
چکیده در این تحقیق با استفاده ازماده ترت بوتیل هیدروپراکساید t-BHPیک مدل حیوانی از استرس اکسیداتیو به منظور مطالعه اثر آن در چگونگی بیان ژن Kdm5d(Smcy) ایجاد گردید. این ژن در مرحله لپتوتن/زیگوتن میوز به کمک فاکتور ترمیمی MSH5سبب دمتیله شدن هیستون 3 لیزین 4 (H3K4) شده و در فشرده شدن کروماتین نقش مهمی داشت.پس از تعیین دوز LD50برای t-BHP، به میزان یک دهم آن به مدت 14 روز به موشهای نر بالغ Balb/c به صورت داخل صفاقی تزریق شد. سپس میزان ROS در بیضه بوسیله فلوسایتومتری اندازهگیری و میزان شکست DNA اسپرم با روش TUNEL سنجیده و بیان ژن Kdm5d مورد ارزیابی قرار گرفت. فلوسایتومتری افزایش استرس اکسیداتیو در موشهای گروه تیماری نسبت به گروه کنترل را نشان داد. همچنین میزان شکست DNAدر موشهای گروه تیماری نسبت به گروه کنترل با آزمایش تانل به اثبات رسید. بیان ژن Kdm5d در گروه آزمون از طریق Real time PCR نشان داده شد. کاهش بیان ژن Kdm5d را میتوان به آسیبهای وارد شده به DNA و سایر مکانیزمها از جمله تغییرات اپیژنتیکی که میتوانند در بیان ژنها تاثیرگذار باشند، نسبت داد. کلمات کلیدی: ناباروری مردان، استرس اکسیداتیو، ژنKdm5d
[شنبه 1398-07-13] [ 07:46:00 ب.ظ ]
لینک ثابت
|